Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRDE2Q9H7Z3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRDE2Q9H7Z3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms