Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR55Q9H6Y2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR55Q9H6Y2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR55Q9H6Y2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms