Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOJQ9H4E5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOJQ9H4E5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms