Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R1

NDST4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST4Q9H3R1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDST4Q9H3R1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST4Q9H3R1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms