Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC68Q9H2F9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC68Q9H2F9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC68Q9H2F9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms