Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG10Q9H0Y0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms