Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB17Q9H0T7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB17Q9H0T7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms