Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIK2Q9H0K1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIK2Q9H0K1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIK2Q9H0K1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIK2Q9H0K1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIK2Q9H0K1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms