Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF541Q9H0D2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF541Q9H0D2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms