Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKRN2Q9H000 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms