Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms