Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPR88Q9GZN0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPR88Q9GZN0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms