Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER1Q9C0I3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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