Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SEMA4CQ9C0C4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA4CQ9C0C4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms