Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM7Q9C029 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM7Q9C029 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms