Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NLRP1Q9C000 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NLRP1Q9C000 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms