Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXP3Q9BZS1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP3Q9BZS1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP3Q9BZS1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms