Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GTPBP4Q9BZE4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTPBP4Q9BZE4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms