Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SCAPERQ9BY12 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SCAPERQ9BY12 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAPERQ9BY12 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms