Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A5Q9BY07 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A5Q9BY07 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A5Q9BY07 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms