Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms