Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL25A1Q9BXS0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL25A1Q9BXS0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms