Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLVAPQ9BX97 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLVAPQ9BX97 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms