Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF7Q9BWX1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms