Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms