Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBB2BQ9BVA1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms