Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RSG1Q9BU20 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RSG1Q9BU20 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms