Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM43Q9BTV4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms