Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCMBPQ9BTE3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCMBPQ9BTE3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms