Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RTKNQ9BST9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms