Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCGF1Q9BSM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF1Q9BSM1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms