Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms