Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCF25Q9BQ70 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF25Q9BQ70 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms