Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP8Q99708 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP8Q99708 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms