Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3CQ99613 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3CQ99613 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms