Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF12Q99081 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms