Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLCC1Q96S66 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLCC1Q96S66 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms