Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEUROD6Q96NK8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD6Q96NK8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEUROD6Q96NK8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms