Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC7Q96M83 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC7Q96M83 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms