Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC17Q96LX7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC17Q96LX7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC17Q96LX7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms