Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK3Q96L96 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALPK3Q96L96 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK3Q96L96 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms