Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EP400Q96L91 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EP400Q96L91 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EP400Q96L91 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms