Protein–RNA interactions for Protein: Q96L33

RHOV, Rho-related GTP-binding protein RhoV, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOVQ96L33 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOVQ96L33 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHOVQ96L33 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms