Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNIP3Q96KP6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNIP3Q96KP6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNIP3Q96KP6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms