Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDLIM2Q96JY6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms