Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A4AQ96JQ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MS4A4AQ96JQ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A4AQ96JQ5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms