Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCHS1Q96JQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCHS1Q96JQ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCHS1Q96JQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms