Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAMP1Q96JM3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHAMP1Q96JM3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms