Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMX3Q96JJ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMX3Q96JJ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMX3Q96JJ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms