Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIG1Q96JA1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRIG1Q96JA1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRIG1Q96JA1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms